西藥數據庫 DrugCentral介紹及使用方法

    在網絡藥理學研究中,通常需要查詢西藥的靶標等信息。大家用DrugBank數據庫比較多。這裏介紹一個新的西藥數據庫DrugCentral. 它的網址是:

 

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     DrugCentral是由美國新墨西哥大學與 Illuminating the Druggable Genome (IDG)項目合作創建和維護的在線藥物信息資源。數據庫提供有關活性成分、化學實體、藥物產品、藥物作用機制、適應症、藥理功能方面的信息,包含FDA(U.S. Food and Drug Administration)、EMA(European Medicines Agency)和PMDA(Japan Pharmaceutical and Medical Devices Agency)批准的藥物並定期更新。DrugCentral於2016年上線,2018年進行了升級。

        

      數據庫中藥物作用機制信息來自若干專家註釋的資源:ChEMBL數據庫、Guide to Pharmacology , KEGG Drug, 以及人工從文獻和藥物標籤提取。藥物功能信息蒐集自 Anatomical Therapeutic Chemical (ATC) 藥物分類系統, the FDA Established Pharmacologic Class (EPC) , Medical Subject Headings (MeSH),Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology. 對2012年以前批准的藥物,適應症信息來自OMOP 詞彙;2012年以後批准的藥物,適應症信息來自藥物標籤並對應到SNOMED-CT概念.

 

    數據庫包含的內容和它們之間的關係見下圖。

 

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    2018年升級版加入了FDA不良事件報告系統(FAERS)信息,FDA橙皮書信息,L1000基因轉錄譜的距離/相似性矩陣和估計的質子化常數。

 

    下面介紹DrugCentral的使用方法。

 

 

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